Čilije nekaj minut pražimo v suhi ponvi na srednji temperaturi, pri čemer pazimo, da se ne zažgejo. Morda se bodo malce napihnili. Nato jim odrežemo peclje in po želji iztresemo semena. Čilije narežemo s škarjami in jih za približno 20 minut namočimo v vročo vodo.

Čilije odcedimo in jih skupaj s preostalimi sestavinami damo v sekljalnik ali možnar. Vse fino zdrobimo in dodamo samo toliko vode, da dobimo konsistenco paste.

Na tej točki lahko končamo, saj smo že dobili odlično pasto iz čilijev chipotle. Shranimo jo v steriliziran kozarček in v hladilnik, kjer se obdrži par tednov.