Čebulo narežemo. Česen drobno nasekljamo. Jajčevec narežemo na kocke. Papriki odstranimo semena in jo narežemo na kocke. Bučke narežemo na tanke kolobarje.

V težki ponvi segrejemo žlico oljčnega olja. Nanj stresemo čebulo in česen ter ju 5 minut rahlo pražimo, da zarumenita. Dodamo jajčevec in papriko in pražimo še 4 minute; če je treba, dodamo še malo olja. Obilno solimo in popramo, vmešamo dimljeno papriko in prilijemo kis ter sojino omako. Prelijemo s pasiranim paradižnikom in pustimo rahlo vreti 5 minut. Ko mešanica postane svetleča in gosta, jo odstavimo z ognja. Ratatouille lahko pripravimo 2 dni vnaprej in ga hranimo v hladilniku.

Pripravimo bešamel. V težki kozici segrejemo mleko, da rahlo zavre. V drugi kozici stopimo maslo in dodamo moko. Zmešamo, da dobimo pasto. Počasi prilivamo vroče mleko in pri tem ves čas stepamo z metlico za stepanje. Pustimo rahlo vreti 2 do 3 minute, da se omaka nekoliko zgosti; medtem ves čas mešamo. Primešamo drobno nastrgan parmezan, malo solimo in popramo.

Ratatouille postrgamo v težko nepregorno posodo in ga povsem prekrijemo z bešamelom. Po njej nadrobimo kozji sir in razporedimo rezine bučk v koncentričnih krogih. Če smo uporabili zelene in rumene bučke, jih razporedimo izmenično. Jed lahko sestavimo več ur pred peko.

Pečico segrejemo na 220 °C (ali na 200 °C z ventilacijo). Po bučkah pokapamo preostalo oljčno olje ali jih z njim premažemo. Pečemo 25 do 30 minut, da se bučke zmehčajo in zlato rjavo zapečejo. Tedaj ratatouille vzamemo iz pečice in pustimo počivati 20 minut, preden ga postrežemo.