Nesreča se je zgodila med dvema otokoma v provinci Sulu, 1000 kilometrov južno od prestolnice Manila, lesena ladja pa je bila na poti v južno mesto Zamboanga.
Reševalne ekipe so rešile 14 ljudi, med njimi sedem otrok. Našli so tudi pet trupel.
Obalna straža je sporočila, da so bližnje ribiške ladje prav tako rešile številne potnike prevrnjene ladje, ki sicer ni bila registrirana in ni opravila inšpekcije.
"Ni mogoče preveriti, koliko je še pogrešanih, ker nimamo podatkov o skupnem številu ljudi na krovu," je dejal tiskovni predstavnik obalne straže William Arquero.
Na Filipinih so ladje in čolni glavna prevozna sredstva, saj gre za arhipelag z več kot 7000 otoki.
Država je bila sicer leta 1987 prizorišče najhujše pomorske katastrofe, ko je le nekaj dni pred božičem trajekt trčil v tanker. V nesreči je umrlo več kot 4300 ljudi.