Čeprav jajca varuje lupina, so občutljiva, saj je lupina porozna, zato skoznjo izgubljajo vlago in se hitro navzamejo močnih vonjev drugih živil. Najbolje je, da jajca v hladilniku hranimo kar v originalni kartonski ali plastični embalaži. Pred tem dobro preverimo, ali so cela, in tista z manjšimi razpokami takoj porabimo, strta jajca pa zavržemo. Tudi umazana jajca zavržemo, predvsem pa jih nikakor ne smemo umivati, ker se zaradi porozne lupine onesnažijo.
Jajca vedno shranjujemo tako, da so obrnjena s koničastim vrhom navzdol, ker tako rumenjak ostane na sredini in so jajca dalj časa sveža. To je še posebej pomembno, če bomo jajca kuhali, saj bo tako rumenjak na sredini.
