McLarnovi inženirji so nadgradili geometrijo vzmetenja in širino koloteka, tu je še varnostna kletka, ki je lažja in manj nerodna kot pri predhodniku in vozniku daje več prostora za glavo in noge. V kabini je dvokraki dirkaški volan, za njim pa posebej razvit dirkaški prikazovalnik.
Lastniki starega 12C GT3 imajo možnost nadgradnje svojega mclarna v 650S GT3, oba avtomobila pa imata enak 3,8-litrski V8 twin turbo. Do leta 2015 naj bi McLaren pripravil 15 primerkov 650S GT3 in prav toliko kompletov za nadgradnjo.
