Mahoney, ki je odstopil s položaja šefa nadškofije leta 2011, je priznal, da je podrejenemu monsinjorju Thomasu Curryju naročil, naj pred policijo skrije seznam ministrantov, ki so službovali pod duhovnikom Nicolasom Aguailarom Rivero.
Ta je otroke spolno zlorabljal po tekočem traku in morda jih še vedno, saj je leta 1988 pobegnil v Mehiko, ZDA pa so za njim razpisale mednarodno tiralico. Med Riverovimi žrtvami je bilo 25 ministrantov in en semeniščnik, sumijo pa ga, da je tudi v Mehiki zlorabil najmanj 100 otrok.
Nekdanji nadškof za svoja dejanja ne bo odgovarjal, ker so večinoma zastarala, pomaga pa tudi dogovor o zunajsodni poravnavi s plačilom odškodnine žrtvam. Mahoney si je sicer že prislužil kritike svojega naslednika, nadškofa Joseja Gomeza glede tega, kako je postopal v škandalu s spolnimi zlorabami. Ščitil je duhovnike in varoval ugled cerkve, za kaznovanje storilcev pa ga ni toliko skrbelo.
