Ruski preiskovalni odbor je tisti organ pregona v Rusiji, ki se običajno ukvarja z najresnejšimi zločini in najpomembnejšemi dogodki v državi, ki terjajo preiskavo. Na njihovi mizi je pristala tudi tragedija leta RA-02795. Letalo Embraer Legacy 600, ki je bilo v lasti Prigožina in na katerem se je nahajalo deset oseb, je namreč v sredo zvečer strmoglavilo med letom v Sankt Peterburg. Umrlo je vseh sedem potnikov in trije člani posadke, vključno s Prigožinom, njegovo desno roko Dmitrijem Utkinom in še nekaterimi poveljniki skupine Wagner. Tako je vsaj kazalo glede na imena na seznamu potnikov, enako pa so malo po nesreči potrdili tudi v ruski zvezni agenciji za zračni promet. Preminulim v strmoglavljenju letala je v četrtek sožalje izrekel ruski predsednik Vladimir Putin. Dogodek je označil za tragedijo, Prigožina pa opisal kot nadarjenega človeka, ki je delal napake.
Da je bil Prigožin med potniki ponesrečenega letala, je zdaj potrdil še ruski preiskovalni odbor, kjer so navedli, da so znanstveniki Prigožinovo smrt potrdili s pomočjo genetske analize. "V okviru preiskave letalske nesreče so bile končane molekularno-genetske preiskave. Glede na njihove rezultate je bila ugotovljena identiteta vseh desetih žrtev, ki se ujema s seznamom potnikov na letalu," je pojasnila tiskovna predstavnica preiskovalnega odbora Svetlana Petrenko.
Čeprav je preiskovalni odbor danes potrdil smrt Prigožina, pa okoliščine strmoglavljenja letala še vedno niso povsem jasne. Ruski preiskovalci so sicer v petek našli črni skrinjici in vseh deset trupel, oblasti pa so zavrnile govorice, da naj bi odredile umor Prigožina.
ZDA medtem ocenjujejo, da je bil Prigožin verjetno na krovu, a ne morejo potrditi, ali je letalo sestrelila raketa zemlja-zrak. Nekateri ameriški uradniki pa menijo, da je bil vzrok strmoglavljenja eksplozija na letalu.