Za njegova namestnika je predsednik države imenoval Jurija Fermeta in Darka Stareta, a funkcije nista nastopila. Odtlej se je Štefanec srečal z nekaj odmevnimi primeri in pozivi k odstopu. Nasprotnike ima tudi v vrstah vodstva KPK, a obenem verjame, da lahko ohrani ugled in vpliv institucije.
Prvo leto Štefaneca zaznamovali spori
Pred natanko enim letom je predsednik republike Pahor na podlagi edinega predloga pristojne izbirne komisije za predsednika KPK imenoval Borisa Štefaneca.