Kržišnik je bil član razširjenega strokovnega kolegija za pediatrijo pri ministrstvu za zdravje vse od leta 1988, v obdobju 1994–2002 pa tudi njegov predsednik. Pod njegovim vodstvom so bile sprejete pomembne smernice za stopenjsko obravnavo bolnih otrok v naši državi. Več kot desetletje je bil tudi nacionalni koordinator specializacije iz pediatrije, so navedli na straneh Zdravniške zbornice Slovenije.
Združenje za pediatrijo SZD mu je leta 2010 podelilo Derčevo priznanje za življenjsko delo na področju pediatrije. Leta 1993 je prevzel vodenje katedre za pediatrijo Medicinske fakultete v Ljubljani in jo vodil dobrih dvajset let. Pod njegovim vodstvom se je število članov skoraj podvojilo, mnogi od njih so dosegli znanstvene in akademske nazive, zaradi katerih se danes ta katedra uvršča med najbolj plodovite klinične katedre Medicinske fakultete v Ljubljani, so dodali. Bil je pobudnik strokovne revije Slovenska pediatrija in vsa leta skrbel za njeno redno izhajanje. Strokovno je vodil tudi vsakoletne Derčeve dneve. Za svoje pedagoško delo je leta 1999 prejel nagrado Društva za visokošolsko didaktiko in leta 2007 Lavričevo priznanje. Na raziskovalnem področju je v uglednih tujih revijah objavil več kot 50 znanstvenih člankov z več kot tisoč citati.
Od njega so se poslovili tudi na Facebook strani Sladkorčki, kjer so med drugim zapisali, da je dolga leta vodil Klinični oddelek za endokrinologijo, diabetes in presnovne bolezni na Pediatrični kliniki. »Bil je enkraten učitelj mladim zdravnikom, zgled dobrega in skrbnega zdravnika in odličen vodja oddelka, pozoren do mladih sladkorčkov in njihovih staršev,« so pojasnili.
»Gradil je znanje tako na področju diabetesa, endokrinologije in presnovnih bolezni. Sodeloval je v številnih projektih, ki so bili pomembni za razvoj diabetologije pri nas, a obenem s svojimi sodelavci skrbel za mlade s sladkorno boleznijo - Klub staršev, revija Sladkorčki, kolonija - poletni tabor, vse je bilo namenjeno dobremu osveščanju o sladkorni bolezni. Register za sladkorno bolezen nas je postavil na zemljevid Evrope in sveta, oblikoval se je sprva v velikih knjigah, kjer smo beležili podatke o družinah s sladkorno boleznijo, kasneje pa je prerastel v sodoben register s katerim se primerjamo z drugimi državami na svetu. Skrb za družine otrok s sladkorno boleznijo se je na našem oddelku začela pred več kot 65 leti in jo želimo ohraniti še naprej - z novimi zdravniki, medicinskimi sestrami, psihologi, dietetiki. Ohranili ga bomo v našem spominu kot velikega človeka in zdravnika,« so še zapisali.
"Bil je človek z velikim Č-jem, ki nas je imel rad. Kjerkoli nas je opazil, je stopil iz vrste in se z nami pogovoril. Ob njem sem preživel mladost v bolnici, kolonijah in spremljal vse novosti, ki jih je prinašal iz sveta, do nove pediatrične klinike, ki mu je bila cilj. Pogrešali vas bomo, vendar boste vedno z nami," je le eden od komentarjev, ki so jih uporabniki družbenih omrežji zapisali ob vesti, da se je za vedno poslovil.
