Rupnik je obremenjen, da je pred tremi desetletji zagrešil več spolnih zlorab redovnic ljubljanske skupnosti Loyola, v kateri je deloval. Obtožbe zoper njega so bile vložene predlani, a je pristojni cerkveni organ ugotovil, da so zastarale, in primer zaključil. Nato so lani v javnost prišle navedbe več redovnic o sistematičnih in več časa trajajočih zlorabah.
Jezuitski red je Rupniku že pred izključitvijo prepovedal vsakršno javno umetniško dejavnost, zlasti v verskih objektih, ter vse oblike duhovniškega udejstvovanja in javno komuniciranje, česar pa se ni držal. Lani avgusta je denimo somaševal v rimski baziliki svete Praksede in s tem ignoriral prepovedi, ki so ga doletele zaradi obtožb o spolnih zlorabah.
Do konca januarja letos je v baziliki Praksede tudi pridigal, kasneje pa v rimski baziliki svetega Janeza v Lateranu še predstavljal svoje mozaike skupini obiskovalcev. Prepovedi, ki so mu jih naložili torej ni spoštoval sam, niti ga k temu ni na nikakršen način prisilila Cerkev ...